Fordi ætiologien og patofysiologien af bækkenbundssyndrom ikke er fuldt ud forstået, er der stadig mange mangler i behandlingsmetoderne for denne tilstand.
Behandling af obstruktiv obstipation
Nogle patienter kræver brug af afføringsmidler. For patienter, der ikke reagerer på en kost med højt-fiberindhold, bør transittiden i tyktarmen ved tilstrækkeligt fiberindtag-måles igen for at afgøre, om en kost med højt-fiber er passende. Til patienter med analspasmer kan der anvendes botulinumtoksin-injektioner, som har en god terapeutisk effekt på analspasmer, og denne behandling har få bivirkninger og komplikationer; til dato er der ikke fundet komplikationer, der bringer patientens liv i fare.
Behandling af rektal prolaps
Der er flere metoder til behandling af rektal prolaps. Under direkte koloskopi kan hæmoride-reducerende injektioner, såsom dem til behandling af hæmorider, injiceres i den høje rektale slimhinde. Dette forårsager aseptisk inflammation og fibrose mellem endetarmsslimhinden og muskellaget eller mellem det høje endetarm og omgivende væv, hvilket fører til adhæsion og fiksering af endetarmen til det omgivende væv.
Derudover er rektal prolaps en af indikationerne for operation. I øjeblikket omfatter kirurgiske procedurer for rektal prolaps: rektal arfiksering, tarmresektion, sphincterfoldning, rektal suspension og fiksering og anal ringning.
Behandling af fækal inkontinens
Hvis fækal inkontinens opstår på grund af skade på den ydre analsfinkter under fødslen eller rektal/analkanaltraume, har sphincteroplastik og perineal rekonstruktion ofte god effekt. For neurogen fækal inkontinens forårsaget af medfødt spinal dysplasi, kan bilateral iliopsoas muskeloverførsel for at styrke og erstatte bækkenbundsmuskler udføres. Postoperativt, kombineret med bækkenbundsmuskelkoordination og tilstødende muskelinduktionstræning, rektalrefleksinduktionstræning og afføringsrefleksrehabiliteringstræning opnås ofte gode resultater.

